電子式表達物質結構時有一定的局限性，例如;O（兩個三中心π鍵）；臭氧（三中心四電子π鍵）；超氧化物（三電子π鍵）；臭氧化物（三中心五電子π鍵）；二氧化碳，一氧化二氮，疊氮根N （三中心四電子π鍵）..等等，都不能用電子式表示其結構。

　　所以我們才說電子式局限性較大，只能表述一小部分物質的結構。而真正意義上的結構是不能用電子式表示的。